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NetCDF は配列を格納するための汎用的なアーカイブフォーマットとして使用できます。NetCDFにおけるデータ圧縮は（低解像度の浮動小数点数を32ビットの配列で表す代わりに8ビットもしくは16ビットの整数配列を使用することにより）可能です。しかし、NetCDFの現行版はデータ圧縮率を最適にする設計にはなっていません。それ故、NetCDFは特定のデータベースのある特徴を生かした特殊目的用アーカイブフォーマットよりも多くのスペースを必要とするかもしれません。