[dennou-ruby:003228] Re: ruby-hdfeos5

[À¾Ëܳ¨Íü»Ò <eriko@xxxxxxxxxxxxxx>]

佐々木さま

西本です. 

解決策ではないのですが, 動作報告です. 
わたしの手元では2つの環境でruby-hdfeos5を使っています. 

どちらの環境でも test/ 以下のサンプルプログラム test_gd.rb test_sw.rb
test_za.rb は問題なく動きます. 
ただ, test_pt.rb だけはどちらでも, 佐々木さんと同じようなエラーが出ま
す. 

ちなみに, ふだんは Aura/MLS などの he5 形式の Swath ファイルを読み出し
て NetCDF 形式に変換するために ruby-hdfeos5 を使用しています. 
その使い方では不具合なく使えています. 

** パッケージの組み合せとエラー
その1) 
ruby 1.8.7 (2008-08-11 patchlevel 72) [x86_64-linux]
libhdf5-serial-1.6.6-0               1.6.6-4
libhdf5-serial-dev                   1.6.6-4
HDF-EOS5.1.12 をコンパイル

#-- エラーメッセージ
HDF5-DIAG: Error detected in HDF5 library version: 1.6.6 thread 139931378431712.  Back trace follows.
  #000: PTapi.c line 5648 in HE5_PTbcklinkinfo(): No Back Linkage Defined between levels: 0 and -1.

    major(05): Low-level I/O layer
    minor(23): Seek failed


その2) 
ruby 1.8.7 (2010-08-16 patchlevel 302) [x86_64-linux]
libhdf5-serial-1.8.4                 1.8.4-patch1-2
libhdf5-serial-dev                   1.8.4-patch1-2
libhe5-hdfeos-dev                    5.1.12.dfsg.2-2+b1
libhe5-hdfeos0                       5.1.12.dfsg.2-2+b1

#-- エラー
HDF5-DIAG: Error detected in HDF5 (1.8.4-patch1) thread
140017989740272:
  #000: PTapi.c line 5723 in HE5_PTfwdlinkinfo(): No Forward Linkage Defined between levels: 1 and 2.

    major: Low-level I/O
    minor: Seek failed


At Tue, 14 Dec 2010 04:32:11 +0900,
Youhei SASAKI <uwabami@xxxxxxxxxxxxxx> wrote:
> 
> 堀之内様, 神代様
> 佐々木です.
> 
> # 古い話で恐縮ですが...
> 
> (佐々木の作業が進まず)頓挫していた ruby-hdfeos5 を Debian 公式に upload
> する作業についての進捗とご質問(というかエラー報告?)です.
> 
> 残念ながら, 時期安定版には ruby-netcdf も ruby-hdfeos5 も入りません/間に
> 合いませんでした. 遅々として進めていこうと思います. それはそれとして,
> 
> ruby-hdfeos5 のパッケージ作成時に test/ 以下の ruby スクリプトを実行して
> いるのですが test/test_gd.rb に関して, 以下のエラー? が出ます.
> %----
> HDF5-DIAG: Error detected in HDF5 (1.8.4-patch1) thread 47033328338144:
>   #000: PTapi.c line 5723 in HE5_PTfwdlinkinfo(): No Forward Linkage Defined between levels: 1 and 2.
> 
>     major: Low-level I/O
>     minor: Seek failed
> HDF5-DIAG: Error detected in HDF5 (1.8.4-patch1) thread 47033328338144:
>   #000: PTapi.c line 5648 in HE5_PTbcklinkinfo(): No Back Linkage Defined between levels: 0 and -1.
> 
>     major: Low-level I/O
>     minor: Seek failed
> HDF5-DIAG: Error detected in HDF5 (1.8.4-patch1) thread 47033328338144:
>   #000: PTapi.c line 5723 in HE5_PTfwdlinkinfo(): No Forward Linkage Defined between levels: 0 and 1.
> 
>     major: Low-level I/O
>     minor: Seek failed
> HDF5-DIAG: Error detected in HDF5 (1.8.4-patch1) thread 47033328338144:
>   #000: PTapi.c line 5723 in HE5_PTfwdlinkinfo(): No Forward Linkage Defined between levels: 0 and 1.
> 
>     major: Low-level I/O
>     minor: Seek failed
> %----
> 
> これは佐々木の環境だけでしょうか?  用いているパッケージのバージョンは以下
> の通りです.
> 
>   - ruby 1.9.2p0 (2010-08-18 revision 29036) [x86_64-linux]
>   - libhdf5-serial-1.8.4, 1.8.4-patch1-2
>   - libhe5-hdfeos-dev, 5.1.12.dfsg.2-2+b1
> 
> 他に必要な情報があれば教えて下さい.
> 
> At Sat, 03 Apr 2010 07:07:22 +0900,
> KOSHIRO Tsuyoshi <koshiro@xxxxxxxxxxxxxx> wrote:
> > また, HDF5 と HDF-EOS5 は必ずしも同じ場所にインストールしてあるとは限
> > らないので(実際に手元でそういう環境がありました), チェックを分けました.
> > 
> > At Wed, 17 Feb 2010 17:51:40 +0900,
> > Takeshi Horinouchi wrote:
> > > 
> > > 堀之内です．
> > > 
> > > 大変遅くなってしまってすみませんが，hdfeos5のrubyラッパーを
> > > リリースしました．バージョンは最初から 1.0 としました：
> > > http://ruby.gfd-dennou.org/products/ruby-hdfeos5/
> > > 
> > > このページにも書きましたが，HDF-EOS5 のほうは，configure 時に
> > > --with-pic をつけてコンパイルするといいようです．試したのは
> > > ruby 1.8.7, gcc 4.3.2 です．
> > > 
> > > HDF-EOS5 のほうもパッケージ化していただけますと，とても
> > > 嬉しいです．＞ 皆さま （いつもすみません．）
> 
> ---
> Youhei SASAKI <uwabami@xxxxxxxxxxxxxx>
>               <uwabami@xxxxxxxxxxxxxxxxxx>
> Department of Mathematics, Kyoto University
> GPG fingerprint:
>   4096/RSA: 66A4 EA70 4FE2 4055 8D6A C2E6 9394 F354 891D 7E07
>