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[dennou-ruby:003976] Re: 巨大なデータでコンターを引く



堀之内です。

> idx=NArray.int(1024).indgen*10
> GGraph.contour gp[idx, true]
> みたいに間引きをやってみましたが、この方法は結構おそいんですね。。。

GGraph.contour gp[{0..-1=>10}, true]

でどうでしょう。(NetCDF-3 なら速くなるで
しょう。NetCDF-4 だと,[dennou-ruby:003840] の事情のため
まさに内部で idx=... 方式に変換するので速くなりませんが。
NetCDF-4 読み飛ばし遅い問題はもう解決したんですかね。
それなら迂回策を廃止できるんですが。)

> ありがとうございます。ulimit -s unlimitedで問題なくいけました。

そんなことかと想像してましたが,"too deep" って変ですね。

> 樫村さま
> 中野です。
> 
> ありがとうございます。ulimit -s unlimitedで問題なくいけました。
> お騒がせしました。
> #MAXNGRIDはいつも10倍することにしてます。
> 
> 
> うまくいくまでは、とりあえずの策で
> idx=NArray.int(1024).indgen*10
> GGraph.contour gp[idx, true]
> みたいに間引きをやってみましたが、この方法は結構おそいんですね。。。
> 
> 
> 中野
> 
> 
> 2016年6月29日 18:00 Hiroki Kashimura <hiroki@xxxxxxxxxxxxxx>:
> > 中野さま:
> >
> > 樫村です。
> >
> > 実は ulimit -s unlimited で描けるようになったりしないでしょうか。
> >
> >
> > あと、DCLのコンパイル時にMAXNGRIDを陽に設定しないと、
> > デフォルト値 4000 が使われるので、軸の長さがそれを超える場合は
> > トーンも描けませんでした。
> >
> >
> > 手元では、(10240x2560のNetCDFファイル bigdata.nc を作っておいて)
> >>gpview bigdata.nc@val
> >  →`uwsgxa': [UWSGXA] WORKING AREA IS NOT ENOUGH. (RuntimeError)
> >
> >>gpview bigdata.nc@val,x=^0:3999
> >  →stack level too deep (SystemStackError)
> >
> >>ulimit -s unlimited
> >>gpview bigdata.nc@val,x=^0:3999
> >  →描画成功
> > でした。
> >
> >
> > 別の方法としては、きれいに描けるか分かりませんが、
> > 描画可能ないくつかのタイルに分けて、重ね書きでしょうか。
> > # 少し試してみたところ、コンターは描けましたが、トーンはダメでした。
> >
> >
> >> 2016/06/28 19:11、Masuo Nakano <masuo@xxxxxxxxxxxxxx> のメール:
> >>
> >> 中野です。
> >>
> >> gphysで巨大なデータ(10240x2560)でコンターをひこうとすると、stack level too deep
> >> (SystemStackError)といわれました。
> >> #トーンはもんだいありませんでした。
> >>
> >> 2560x2560だと問題なくコンター引けることがわかりました。
> >> とりあえずはデータを間引けばよさそうですが、なにか他によい対処方法はありますでしょうか?
> >>
> >> ruby 2.2.0
> >> dcl-c 6.0.0
> >> ruby-dcl-1.7.1
> >> gphys-1.4.3
> >> を使っております。
> >>
> >> cc-env/lib/ruby/site_ruby/2.2.0/numru/dcl.rb:1012:in `udcntz': stack
> >> level too deep (SystemStackError)
> >> from cc-env/lib/ruby/site_ruby/2.2.0/numru/dcl.rb:1012:in `udcntz'
> >> from cc-env/lib/ruby/site_ruby/2.2.0/numru/ggraph.rb:2590:in `contour'
> >> from ps_dp-sp_resolution.rb:62:in `<main>'
> >>
> >> どうぞよろしくお願いいたします。
> >>
> >> 中野
> >>
> >>
> >
> > 樫村(山本)博基
> > hiroki@xxxxxxxxxxxxxx
> >
> >
> >
> 
> 

堀之内 武