NEC SX-8 FORTRAN90/SX での gtool5 インストール

以下は, NEC SX-8 FORTRAN90/SX (クロスコンパイル環境) において gtool5 ライブラリをビルド, インストールした際のメモ書きです.

gt4f90io の際のメモについては NEC SX-6 FORTRAN90/SX での gt4f90io インストールを参照してください.

netCDF ライブラリの準備

netCDF ライブラリを準備し, ライブラリを置いてあるパスを調べておいてください.

なお, netCDF をクロスコンパイル環境で作成するのはなかなか困難です. セルフコンパイルできるようにするか, もしくはシステム管理者に用意してもらう方が無難でしょう.

過去に試行錯誤した内容については, NEC SX-6 FORTRAN90/SX での gt4f90io インストールの「クロスコンパイル環境で netCDF をビルドする際の問題」を参照ください.

ダウンロード・展開

gtool プロジェクトより gtool5 の tar.gz パッケージをダウンロードします.

ダウンロードしたパッケージを zcat と tar で展開し, 作成されたディレクトリに移動します.

$ zcat gtool5-20XXMMDD.tar.gz | tar -xvf -
$ cd gtool5-20XXMMDD

ビルド

環境変数 FC を指定し, configure スクリプトを起動します. (csh の場合は別途環境変数を指定してください). --with-netcdf には先に作成した netCDF ライブラリを指定してください. "SYSFFLAGS=-ftrace SYSLDFLAGS=-ftrace" はプロファイラを使用しない場合には削除してください.

$ FC=sxf90 MAKE=make AR=sxar RANLIB=touch \
  NCDUMP=/usr/bin/ncdump SYSFFLAGS=-ftrace SYSLDFLAGS=-ftrace \
  ./configure --prefix=/home/username/lib/gtool5 \
  --with-netcdf=/usr/local/lib/libnetcdf.a --host=sx8-nec-superux \
  --with-getenv=nostd

configure スクリプトによるチェックが完了したら, ビルドを行います.

$ make

インストール

ビルドが完了したらインストール行います.

$ make install

gt5frt によって正しくコンパイルとリンクが行われるか, 以下のコマンドで確認します.

$ make test-installed

ライブラリはクロスコンパイルされているため, 実行は別途行うべく下記のようなメッセージが表示されます.

Cross compile mode will be used.
First, change directory to ./test .
Secondly, submit ...
     dc_string_test ... histtest ...,

Thirdly, change directory to ./ .
Last "make test-installed-c"

下記のような実行シェルを作成し, デバッグ用のジョブクラスへ投入します. (SYSLEN や F_FF0 に関しては, 実行シェルで指定する環境変数 を参照してください).

#!/bin/sh
#PBS -q v_deb
#PBS -b 1
#PBS -o stdout.log -e stderr.log
#PBS -v F_SYSLEN=32767
#PBS -v F_ERRMSG=STDOUT
#PBS -v F_FF0=stderr.log
#PBS -v F_PROGINF=detail
#PBS -I "/home/username/gtool5-20XXMMDD/test/dc_clock_test,./in/"
cd $STGDIR
cd in
./dc_clock_test

dc_args_test に関しては以下のような実行シェルを記述し, 投入してください.

#!/bin/sh
#PBS -q v_deb
#PBS -b 1
#PBS -o stdout.log -e stderr.log
#PBS -v F_SYSLEN=32767
#PBS -v F_ERRMSG=STDOUT
#PBS -v F_FF0=stderr.log
#PBS -v F_PROGINF=detail
#PBS -I "/home/username/gtool5-20XXMMDD/test/dc_args_test,./in/"
cd $STGDIR
cd in
./dc_args_test arg1 arg2 arg3 --namelist=test.nml -s

上記の "Secondly, submit ..." にリストされるものを一通り投入し, エラーが発生しないことを確認した後, 元のディレクトリに移動後, 以下のコマンドを実行してテストを完了します.

$ make test-installed-c

gt5frt へのパスの設定

~/.bashrc など, シェルの初期化ファイルに gt5frt へのパスを設定します. 以下はその例です.

$ vi ~/.bashrc

  PATH=$PATH:/home/username/lib/gtool5/bin ; export PATH

これで gtool5 ライブラリのビルドとインストールは完了です.